SNP formula

Univerza v Ljubljani
Biotehniška fakulteta
Oddelek za zootehniko
Katedra za znanosti o rejah živali

Podatkovno skladišče GOVEDO

Mobile Natisni Prijava

Domov>Učinek SNP - Lastnost

Koda obračuna

Izberi lastnost


Rezultati se bodo izpisali za izbrano lastnost. Prednastavljena je lastnost 'količina mleka kg'. Lahko izbiraš med vsemi lastnostmi s katerimi sodelujemo v mednarodnem genomskem obračunu za rjavo pasmo.

Snp Name	Chr	Position	Snp Index	Current Freq	Snp Effect	Base Freq	Snp W	Rang	Prang	Sum Up	Sum Down	RS*
UA-IFASA-4369	1	141531071	3065	0.18720	-0.0012466900	0.23190	0.0012466900	24182	53.40312	84.22977	15.76864	rs29026456
BTA-07775-no-rs	1	38649369	785	0.06440	0.0008204800	0.14120	0.0008204800	30496	67.34685	92.51501	7.48394	rs29027438
Hapmap57645-rs29027916	1	150363389	3291	0.52950	-0.0012709280	0.59200	0.0012709280	23832	52.63018	83.66848	16.32990	rs29027916
Hapmap52330-rs29021130	1	137391425	2977	0.66290	0.0009967030	0.62510	0.0009967030	27763	61.31134	89.34823	10.65050	rs29021130
Hapmap53238-rs29021199	1	81516088	1722	0.18660	0.0009653910	0.22420	0.0009653910	28274	62.43982	89.98670	10.01207	rs29021199
Hapmap59750-rs29024375	1	3601437	93	0.61460	0.0015481700	0.66770	0.0015481700	20205	44.62038	77.17562	22.82241	rs29024375
Hapmap60655-rs29025422	1	72052010	1530	0.47910	0.0029708000	0.39880	0.0029708000	7867	17.37335	43.03600	56.96022	rs29025422
BTA-17925-no-rs	1	92856829	1981	0.01540	-0.0005107150	0.06160	0.0005107150	35726	78.89669	96.94982	3.04953	rs41575292
Hapmap40403-BTA-15429	1	66230091	1403	0.26420	-0.0012678640	0.32000	0.0012678640	23879	52.73398	83.74449	16.25389	rs41575648
Hapmap39970-BTA-117984	1	38863022	789	0.55270	-0.0026562460	0.58310	0.0026562460	9808	21.65982	49.98730	50.00931	rs41571631
BTA-45195-no-rs	1	100297745	2139	0.52920	0.0001346370	0.56010	0.0001346370	42649	94.18533	99.77501	0.22482	rs41585816
UA-IFASA-9174	1	64592861	1363	0.36940	-0.0025113350	0.41550	0.0025113350	10890	24.04929	53.54805	46.44875	rs41593713
BTA-98511-no-rs	1	117929353	2516	0.05620	0.0000359020	0.09620	0.0000359020	44583	98.45634	99.98510	0.01485	rs41594021
Hapmap50536-BTA-99808	1	125641702	2687	0.11560	0.0010771010	0.21030	0.0010771010	26609	58.76286	87.82529	12.17334	rs41596878
BTA-95639-no-rs	1	76709967	1620	0.23040	0.0014148260	0.24370	0.0014148260	21860	48.27525	80.29690	19.70130	rs41598314

1 - 15 of 45282

Opombe
* RS številke za SNP_NAME smo pridobili na spletni strani http://bioinformatics.tecnoparco.org/SNPchimp/index.php/download/download-cow-data na dan 23.7.2018. V tem času so se lahko stvari tudi spremenile.

nobody

en-us

Avtorji: Miran Štepec, Jurij Krsnik, Barbara Luštrek, Klemen Potočnik