SNP formula

Univerza v Ljubljani
Biotehniška fakulteta
Oddelek za zootehniko
Katedra za znanosti o rejah živali

Podatkovno skladišče GOVEDO

Mobile Natisni Prijava

Koda obračuna

Izberi lastnost


Rezultati se bodo izpisali za izbrano lastnost. Prednastavljena je lastnost 'količina mleka kg'. Lahko izbiraš med vsemi lastnostmi s katerimi sodelujemo v mednarodnem genomskem obračunu za rjavo pasmo.

Snp Name	Chr	Position	Snp Index	Current Freq	Snp Effect	Base Freq	Snp W	Rang	Prang	Sum Up	Sum Down	RS*
UA-IFASA-4369	1	141531071	3065	0.18310	-0.0009492470	0.23230	0.0009492470	28756	63.45242	90.48650	9.51232	rs29026456
BTA-07775-no-rs	1	38649369	785	0.06570	0.0003903070	0.14120	0.0003903070	38089	84.04643	98.24796	1.75155	rs29027438
Hapmap57645-rs29027916	1	150363389	3291	0.52500	-0.0006103480	0.60110	0.0006103480	34273	75.62612	95.86294	4.13630	rs29027916
Hapmap52330-rs29021130	1	137391425	2977	0.67890	0.0002253790	0.62080	0.0002253790	41143	90.78532	99.41950	0.58022	rs29021130
Hapmap53238-rs29021199	1	81516088	1722	0.17610	0.0005268030	0.22040	0.0005268030	35702	78.77932	96.88028	3.11906	rs29021199
Hapmap59750-rs29024375	1	3601437	93	0.61910	0.0010907870	0.67030	0.0010907870	26661	58.82963	87.80988	12.18876	rs29024375
Hapmap60655-rs29025422	1	72052010	1530	0.47900	0.0021671420	0.40720	0.0021671420	14032	30.96273	62.74204	37.25524	rs29025422
BTA-17925-no-rs	1	92856829	1981	0.01370	-0.0002352410	0.05690	0.0002352410	40945	90.34842	99.36236	0.63734	rs41575292
Hapmap40403-BTA-15429	1	66230091	1403	0.26640	-0.0012335330	0.32420	0.0012335330	24658	54.40985	84.89777	15.10069	rs41575648
Hapmap39970-BTA-117984	1	38863022	789	0.55460	-0.0026974300	0.58400	0.0026974300	9841	21.71495	50.06536	49.93127	rs41571631
BTA-45195-no-rs	1	100297745	2139	0.51540	-0.0000585360	0.56150	0.0000585360	44194	97.51760	99.95920	0.04073	rs41585816
UA-IFASA-9174	1	64592861	1363	0.36950	-0.0022733110	0.41190	0.0022733110	13074	28.84883	60.08275	39.91440	rs41593713
BTA-98511-no-rs	1	117929353	2516	0.05050	0.0001112530	0.08840	0.0001112530	43221	95.37060	99.85628	0.14358	rs41594021
Hapmap50536-BTA-99808	1	125641702	2687	0.11200	0.0002710400	0.20880	0.0002710400	40268	88.85456	99.14723	0.85243	rs41596878
BTA-95639-no-rs	1	76709967	1620	0.22410	0.0020217950	0.24340	0.0020217950	15379	33.93499	66.27141	33.72606	rs41598314

1 - 15 of 45319

Opombe
* RS številke za SNP_NAME smo pridobili na spletni strani http://bioinformatics.tecnoparco.org/SNPchimp/index.php/download/download-cow-data na dan 23.7.2018. V tem času so se lahko stvari tudi spremenile.

nobody

en

Avtorji: Miran Štepec, Jurij Krsnik, Barbara Luštrek, Klemen Potočnik