SNP formula

Univerza v Ljubljani
Biotehniška fakulteta
Oddelek za zootehniko
Katedra za znanosti o rejah živali

Podatkovno skladišče GOVEDO

Mobile Natisni Prijava

Koda obračuna

Izberi lastnost


Rezultati se bodo izpisali za izbrano lastnost. Prednastavljena je lastnost 'količina mleka kg'. Lahko izbiraš med vsemi lastnostmi s katerimi sodelujemo v mednarodnem genomskem obračunu za rjavo pasmo.

Snp Name	Chr	Position	Snp Index	Current Freq	Snp Effect	Base Freq	Snp W	Rang	Prang	Sum Up	Sum Down	RS*
UA-IFASA-4369	1	141531071	3065	0.18550	-0.0010443400	0.23280	0.0010443400	27339	60.34433	88.68595	11.31274	rs29026456
BTA-07775-no-rs	1	38649369	785	0.06500	0.0003461950	0.13990	0.0003461950	38829	85.70577	98.59828	1.40129	rs29027438
Hapmap57645-rs29027916	1	150363389	3291	0.52480	-0.0009841250	0.59200	0.0009841250	28278	62.41695	89.88141	10.11736	rs29027916
Hapmap52330-rs29021130	1	137391425	2977	0.67560	0.0003809220	0.62300	0.0003809220	38211	84.34168	98.31631	1.68322	rs29021130
Hapmap53238-rs29021199	1	81516088	1722	0.17910	0.0007442180	0.22080	0.0007442180	32089	70.82883	94.01600	5.98306	rs29021199
Hapmap59750-rs29024375	1	3601437	93	0.61820	0.0013203760	0.67290	0.0013203760	23477	51.81989	82.96661	17.03173	rs29024375
Hapmap60655-rs29025422	1	72052010	1530	0.47890	0.0024136310	0.40440	0.0024136310	11869	26.19799	56.49469	43.50228	rs29025422
BTA-17925-no-rs	1	92856829	1981	0.01420	-0.0004308170	0.05760	0.0004308170	37320	82.37501	97.86229	2.13717	rs41575292
Hapmap40403-BTA-15429	1	66230091	1403	0.26520	-0.0015969680	0.32150	0.0015969680	19873	43.86492	76.37366	23.62433	rs41575648
Hapmap39970-BTA-117984	1	38863022	789	0.55580	-0.0025739530	0.58380	0.0025739530	10642	23.48968	52.65530	47.34147	rs41571631
BTA-45195-no-rs	1	100297745	2139	0.51950	-0.0003136720	0.56160	0.0003136720	39459	87.09635	98.85910	1.14051	rs41585816
UA-IFASA-9174	1	64592861	1363	0.36810	-0.0022798180	0.41190	0.0022798180	12980	28.65026	59.76615	40.23098	rs41593713
BTA-98511-no-rs	1	117929353	2516	0.05180	0.0003696470	0.08940	0.0003696470	38414	84.78976	98.41201	1.58753	rs41594021
Hapmap50536-BTA-99808	1	125641702	2687	0.11330	0.0004582310	0.21090	0.0004582310	36848	81.33319	97.59872	2.40071	rs41596878
BTA-95639-no-rs	1	76709967	1620	0.22610	0.0016896300	0.24110	0.0016896300	18852	41.61130	74.26792	25.72996	rs41598314

1 - 15 of 45305

Opombe
* RS številke za SNP_NAME smo pridobili na spletni strani http://bioinformatics.tecnoparco.org/SNPchimp/index.php/download/download-cow-data na dan 23.7.2018. V tem času so se lahko stvari tudi spremenile.

nobody

en

Avtorji: Miran Štepec, Jurij Krsnik, Barbara Luštrek, Klemen Potočnik