SNP formula

Univerza v Ljubljani
Biotehniška fakulteta
Oddelek za zootehniko
Katedra za znanosti o rejah živali

Podatkovno skladišče GOVEDO

Mobile Natisni Prijava

Domov>Učinek SNP - Lastnost

Koda obračuna

Izberi lastnost


Rezultati se bodo izpisali za izbrano lastnost. Prednastavljena je lastnost 'količina mleka kg'. Lahko izbiraš med vsemi lastnostmi s katerimi sodelujemo v mednarodnem genomskem obračunu za rjavo pasmo.

Snp Name	Chr	Position	Snp Index	Current Freq	Snp Effect	Base Freq	Snp W	Rang	Prang	Sum Up	Sum Down	RS*
UA-IFASA-4369	1	141531071	3065	0.18560	-0.0010257390	0.23580	0.0010257390	27025	62.36586	89.87884	10.11988	rs29026456
BTA-07775-no-rs	1	38649369	785	0.05700	0.0014158530	0.11390	0.0014158530	21986	50.73731	82.22234	17.77589	rs29027438
Hapmap57645-rs29027916	1	150363389	3291	0.53720	-0.0005048130	0.59580	0.0005048130	34856	80.43754	97.32227	2.67709	rs29027916
Hapmap52330-rs29021130	1	137391425	2977	0.63900	0.0016357470	0.61390	0.0016357470	19465	44.91958	77.40887	22.58908	rs29021130
Hapmap53238-rs29021199	1	81516088	1722	0.19350	0.0019723030	0.21770	0.0019723030	15914	36.72490	69.40793	30.58960	rs29021199
Hapmap50897-BTA-14167	1	75664393	1604	0.49160	-0.0041244430	0.51370	0.0041244430	3860	8.90776	26.63691	73.35793	rs29022932
Hapmap59750-rs29024375	1	3601437	93	0.60340	0.0009314870	0.64940	0.0009314870	28382	65.49743	91.54126	8.45757	rs29024375
Hapmap60655-rs29025422	1	72052010	1530	0.47640	0.0030144550	0.40250	0.0030144550	8228	18.98784	45.83748	54.15875	rs29025422
BTA-17925-no-rs	1	92856829	1981	0.01420	-0.0003681080	0.04940	0.0003681080	37140	85.70835	98.57449	1.42505	rs41575292
Hapmap40403-BTA-15429	1	66230091	1403	0.26080	-0.0003406810	0.32480	0.0003406810	37608	86.78836	98.78251	1.21706	rs41575648
Hapmap39970-BTA-117984	1	38863022	789	0.55270	-0.0017661570	0.58760	0.0017661570	17992	41.52032	74.26834	25.72945	rs41571631
BTA-45195-no-rs	1	100297745	2139	0.54400	-0.0010779040	0.56060	0.0010779040	26258	60.59585	88.86891	11.12974	rs41585816
UA-IFASA-9174	1	64592861	1363	0.36860	-0.0029405840	0.41570	0.0029405840	8650	19.96169	47.41324	52.58307	rs41593713
BTA-98511-no-rs	1	117929353	2516	0.05730	-0.0002010840	0.08850	0.0002010840	39937	92.16302	99.57167	0.42808	rs41594021
Hapmap50536-BTA-99808	1	125641702	2687	0.11810	0.0013568960	0.20510	0.0013568960	22684	52.34809	83.43514	16.56316	rs41596878

1 - 15 of 43333

Opombe
* RS številke za SNP_NAME smo pridobili na spletni strani http://bioinformatics.tecnoparco.org/SNPchimp/index.php/download/download-cow-data na dan 23.7.2018. V tem času so se lahko stvari tudi spremenile.

nobody

en-us

Avtorji: Barbara Luštrek, Miran Štepec, Jurij Krsnik, Klemen Potočnik